• reprezentuje Kolegium na zewnątrz,
• przedkłada, po przyjęciu przez Zgromadzenie Ogólne Kolegium, Prezesowi Rady Ministrów, ministrowi właściwemu do spraw administracji publicznej i Sejmikowi Województwa roczną informację o działalności Kolegium w terminie do końca I kwartału roku następującego po roku objętym informacją,
• opracowuje projekt regulaminu organizacyjnego Kolegium,
• zgłasza wniosek o ustalenie liczby członków Kolegium,
• ogłasza konkurs na członków Kolegium,
• przewodniczy pracom komisji konkursowej,
• przedstawia kandydatów na członków Kolegium wyłonionych w drodze konkursu,
• występuje z wnioskami o powołanie i o odwołanie Wiceprezesa Kolegium oraz członka Kolegium,
• czuwa nad jednolitością orzecznictwa oraz sprawnością pracy Kolegium,
• wyznacza przewodniczących składów orzekających.

Prezes Kolegium wykonuje również czynności przewidziane przepisami prawa dla organów administracji publicznej, niezastrzeżone dla składu orzekającego.

Prezes Kolegium dokonuje, w imieniu Kolegium, czynności z zakresu prawa pracy wobec etatowych członków Kolegium oraz pracowników Biura Kolegium.
Prezes Kolegium wydaje postanowienia sygnalizacyjne w przypadku stwierdzenia istotnych uchybień w pracy organu jednostki samorządu terytorialnego.